11 марта 2020 года задержан после обыска. Возбуждено дело об участии в деятельности террористической организации. На следующий день суд постановил взять Сейтмеметова под стражу. 29 октября 2021 года приговорен к 13 годам колонии строгого режима. У Рустема есть проблемы со здоровьем - катаракта обоих глаз и проблемы с позвоночником.